Chapitre I : Le soleil avant la pluie.
L'archipel Oméga, un archipel formé de deux îles, l'Île Delta, la plus petite, et l'Île Oméga, la plus grande. La vie est paisible dans cette région du monde des Pokémon. Les êtres humains et les Pokémon vivent en harmonie et s'entraident dans la vie de tous les jours. Les combats Pokémon du château Oméga de la ville de Fort-Delta, la seule ville de l'Île Delta, font partie de la tradition de cette région. Mais un événement tragique mit fin à la vie tranquille dans une ville située dans les montagnes de l'est de l'Île Oméga, Ghost City. La Tour Noire, située au sud de la ville, jadis scellée pour cause de son atmosphère obscur, laissa dégager tout son pouvoir sur la ville qui dût être désertée étant donné que les Pokémon devenus obscurs avaient attaqué les habitants. On dit que le Pokémon le plus obscur y était enfermé.
C'est alors qu'un Pokémon, accompagné de son meilleur ami, décidèrent d'aller voir ce qui s'était passé à Ghost City. Ce Pokémon, c'était une Latias, et son meilleur ami était un Brutalibré. Ce Brutalibré était d'une couleur différente de celle des autres Brutalibré. Ses ailes étaient de couleur noire et violette. Son corps était de couleur rouge et noire et sa tête de couleur verte et violette. Il était très courageux et n'hésitait pas à aider sa meilleure amie, Latias. Cette dernière était très intelligente mais également très craintive, c'est pour cela que ces Pokémon s'accordaient si bien. Il vivaient tranquillement à Ecornia, tout à l'est de la région, mais décidèrent de voyager ensemble pour découvrir des choses qu'ils ne connaissaient pas quand ils vivaient dans la Tour Pokémon de cette ville, se situant au nord de la Zone de Combat. Aucun être humain ne peut accéder à cette tour, étant donné qu'elle est incluse dans le patrimoine naturel Oméga.
Ces deux amis commencèrent leur voyage en allant tout d'abord dans la Grotte Frontier, celle qui relie Ecornia au reste de la région. À l'intérieur, il y avait de nombreux Pokémon, dont des Gravalanch et des Nosferalto. Latias craignait les Nosferalto, mais Brutalibré tenta bien que mal de la rassurer. Ils sortirent rapidement de la grotte afin d'accéder à la ville de New Ghost, au sud des montagnes de l'est. Cette ville a été fondée suite au drame de Ghost City. Les deux Pokémon ne restèrent pas longtemps, juste le temps de se reposer. Après un long repos d'une journée, ils décidèrent d'aller vers l'ouest. Ils empruntèrent le Chenal Tourbillon et rencontrèrent un Pokémon blessé. C'était un Artikodin. Latias décida d'aller rapidement à Lenantia, la plus grande ville de la région située au sud-ouest du chenal. Arrivés à la ville, les Pokémon ne savaient que faire.
« Il faudrait peut-être faire appel à l'aide des médecins, questionna Brutalibré.
- Mais on ne peut pas faire confiance aux humains, dit Latias inquiète.
- Mais il faut faire quelque chose, répondit l'oiseau combattant, si on ne fait rien, il pourrait...
- Non, impossible, rétorqua l'éon.
- Écoute, j'y vais, toi, prends soin de lui, dit le lutteur. »
C'est ainsi que Brutalibré décida d'aller au centre Pokémon pendant que Latias prenait soin d'Artikodin. Arrivé au centre Pokémon, Brutalibré réussit à convaincre l'infirmière de le suivre. Elle arriva et vit Artikodin, et, après un diagnostic, elle dit que s'il n'allait pas au centre Pokémon pour être soigné comme il se doit, il pourrait mourir. C'est alors qu'elle appela une ambulance pour transporter Artikodin jusqu'au centre. Quelques heures plus tard, au centre Pokémon, Artikodin fut soigné et sortit en pleine forme. Les trois Pokémon allèrent sur la Route Boisée, au sud de Lenantia, et se cachèrent dans les bois.
« Qu'est-ce qui t'est arrivé, demanda Latias à Artikodin.
- Lugia m'a attaqué à Ghost City, répondit tristement Artikodin.
- Comment ça, questionna Brutalibré.
- Je ne sais pas, il est devenu bizarre en entrant dans la ville, et s'est mis à nous attaquer, moi, Électhor et Sulfura, répondit l'oiseau de glace.
- Il faut donc découvrir ce qui leur est arrivé, dit Latias.
- Et là, s'exclama le Pokémon Catcheur, nous saurons ce qui est arrivé à Lugia ! »
C'est donc ainsi que les trois Pokémon décidèrent de chercher les deux oiseaux légendaires. Ils commencèrent par aller dans la direction de la Ville Blanche. Là-bas, il y a une centrale électrique, ce qui les amena à penser qu'Électhor y serait. Sur la route, il se cachèrent des dresseurs pouvant tenter de les capturer. En espionnant les conversations des dresseurs, ils apprirent qu'il avait un problème à la centrale. Ils s'y précipitèrent pour voir si ce n'était pas Électhor qui causait ce problème.
En arrivant à la centrale, ils virent Électhor emmêlé dans les câbles d'alimentation. Latias et Brutalibré cherchèrent alors à démêler l'oiseau électrique sans couper les câbles afin que la ville puisse être de nouveau alimentée en électricité. Après plusieurs heures à réfléchir, Latias trouva la solution. Électhor fut libéré et remercia les deux Pokémon.
« C'est tout naturel, dit Latias, mais comment se fait-il que tu te soit emmêlé ainsi ?
- C'est suite à l'attaque Aéroblast de Lugia qui semblait bizarre, répondit Électhor.
- Bizarre, demanda Brutalibré.
- Oui, répondit le Pokémon Électrique, son attaque était entourée d'une aura noire.
- Il faut à tout prix élucider ce mystère avant qu'il n'y ait plus de dégâts, s'exclama l'éon.
- Ceci sera le but de notre voyage, dit Brutalibré avec enthousiasme.
- Allons-y, cria Latias. »
C'est ainsi que commença le voyage de ces amis qui étaient prêts à tout pour découvrir la vérité. Ils savaient que ce voyage allait être dangereux, mais ils étaient prêts à affronter tous les dangers. Ils croiseront la route de nombreux Pokémon et de nombreux dresseurs.